Sau khi Liên Xô tan rã, Hội đồng Bộ trưởng trở thành cơ quan hành pháp của Tổng thống. Có khi Hội đồng có 12 Phó Thủ tướng, 60 Bộ và Ủy ban Nhà nước. Sau khi cải tổ năm 2004 hiện nay Chính phủ còn 17 Bộ, 7 Cục và 30 cơ quan Chính phủ.

Theo Hiến pháp Nga, điều 111 "Thủ tướng được bổ nhiệm bởi Tổng thống và do Duma quốc gia phê chuẩn". Nếu Tổng thống mất khả năng điều hành thì Thủ tướng có quyền hạn như Tổng thống.